A Secretaria de Saúde atua com o planejamento, programação, organização, coordenação, controle e execução de atividades relacionadas com a saúde pública; medicina preventiva; atuação médico-sanitária integrada; odontologia sanitária; educação para a saúde; fiscalização sanitária e atividades complementares de saneamento.
Entre os programas e serviços prestados estão o Centro de Atenção Psicossocial (CAPS), o Centro de Especialidades Odontológicas (CEO), as Estratégias Saúde da Família (EFS), o Posto de Atendimento Médico (PAM), o Tratamento Fora de Domicílio (TFD), a Vigilância Entomológica - Dengue, a Vigilância Epidemiológica, a Vigilância Sanitária, a Farmácia Central e o Serviço de Atendimento Médico de Urgência (SAMU), Clínica de Fisioterapia, SESI.
São vinculados à Secretaria o Departamento de Administração da Saúde, o Departamento de Vigilância em Saúde, o Departamento de Atenção Básica, o Departamento de Serviços de Média e Alta Complexidade, a Gerência de Unidades Básicas de Saúde e a Gerência de Regulação, Controle e Avaliação.